La actividad académica del CARI es llevada a cabo por un equipo de trabajo que organiza el funcionamiento general de la institución. El componente fundamental de este esquema es la Secretaría Académica, la cual maneja la agenda del Consejo y coordina el trabajo de los distintos Institutos, Comités y Grupos de Trabajo. Estos mismos desarrollan sus actividades cubriendo temas y regiones diferentes y están integrados por expertos que colaboran ad-honorem con el Consejo
La labor de estos Institutos, Comités de Estudio y Grupos de Trabajo es extensa en cuanto a temas y regiones y variada en cuanto a sus formas de trabajar. Ellos constituyen una pieza central en las actividades del Consejo, ya sea organizando publicaciones, seminarios o conferencias públicas o reuniones de consulta con funcionarios públicos y expertos de la sociedad civil
Además de los órganos de estudio que actualmente están en actividad, a lo largo de la vida del CARI han desarrollado tareas diversos Comités de Estudio de carácter permanente, entre ellos los Comités sobre Análisis de la Situación Internacional Actual, de Asuntos Consulares, de Finanzas, de Negociaciones Económicas Internacionales, de Medios de Comunicación, sobre Nuevos Riesgos a la Seguridad Internacional, sobre Política de Estado sobre el Tema Mujer, de Promoción de la Cultura Argentina, sobre Reforma del Consejo de Seguridad, de Seguimiento de los Problemas Internacionales Contemporáneos y el Comité de Asuntos Culturales y, como parte de este último, las Comisiones de Artes Plásticas, Letras, Teatro y Cine y Comisión para la Preservación y Defensa del Patrimonio Cultural Argentino
Han funcionado además los siguientes Comités de Estudios Especiales: Proyección Externa de la Empresa Argentina, La Argentina en el Proceso de Reestructuración de la ALALC, El Ingreso de España en la Comunidad Europea: Posibles Impactos en las Relaciones Económicas de la Argentina con España, Servicio Exterior Argentino, Deuda Externa, La Argentina como Productor Mundial de Alimentos, Seguridad Latinoamericana, Financiamiento Externo, Comercio Exterior, Reforma Económica Argentina, El NAFTA y la Unión Europea y Reforma del Consejo de Seguridad
En el seno del CARI también han desarrollado tareas el Seminario Permanente para el Estudio, Prevención y Resolución de Conflictos y el Seminario Permanente sobre Europa Central y Oriental, el Centro de Estudios de Política Exterior y los siguientes Grupos de Trabajo: Grupo Buenos Aires de la Negociación Internacional, Grupo de Trabajo sobre Mercados Emergentes, Grupo de Investigación y Registro Testimonial (GIRT), Seguimiento y Propuestas para las Negociaciones Multilaterales de Servicios, Agenda de Seguridad, ALCA-Mercosur, Consensos en Política Exterior, Ceremonial y Protocolo y el Grupo de Trabajo sobre Lecciones Aprendidas de la Experiencia Argentina en las Operaciones de Paz de Naciones Unidas